Spesialingeniør - Bioinformatikk Medarbeidar

Om stillinga
Kreftgenomikk er ein avdeling i Laboratorieklinikken med ansvar for avansert molekylær kreftdiagnostikk og består av to seksjonar; Blodgenomikk og Tumorgenomikk. Avdelinga nyttar ulike molekylære analysemetodar på kromosom, DNA og RNA nivå for å undersøke endringar i genomet som er viktige for diagnostikk og behandling. Laboratoriet er akkreditert ihht ISO 15189 standarden. Helse Bergen HF er eit infrastruktur for presisjonsdiagnostikk (InPreD) nivå 1 sjukehus hvor Kreftgenomikk har ei sentral rolle i utprøving, utvikling og innføring av nødvendige laboratorieanalysar for presisjonsmedisin.
Avdelinga er ein av åtte einingar i Laboratorieklinikken. Kreftgenomikk samarbeider tett med Avdeling for patologi, Avdeling for medisinsk genetikk, Avdeling for medisinsk biokjemi og farmakologi, Regionalt kompetansesenter for arveleg kreft, Seksjon for bioinformatikk og Biobank Haukeland. Dei tilsette har ulik yrkesfagleg bakgrunn med høg fagleg kompetanse (helsesekretær, bioingeniørar, molekylærbiologar og legar).
Vi har ledig 100% fast stilling som spesialingeniør som jobbar som bioinformatikk medarbeidar. Bioinformatikk medarbeidaren vil jobbe tett saman med Seksjon for bioinformatikk og inngå i ulike nasjonalt samarbeid.
- Nøkkelinformasjon
- Søknadsfrist:
** **
- Arbeidsgivar:
**Helse Bergen HF**
- Stillingstittel:
**Spesialingeniør - Bioinformatikk medarbeidar**
- Stillingar:
**1**
- Heiltid / Deltid:
**Heiltid**
- Tilsetjingsform:
**Fast**
- Stillingsprosent:
**100**
- Webcruiter-ID:
** **
Del på XDel på FacebookArbeidsoppgåver
Bioinformatikkmedarbeidaren vil bidra i eller leie arbeid med
- utvikling, validering og drift av programvare og pipelines for analyse av ulike typar NGS-data
- utvikling og drift av ulike laboratoriestøttesystem
- utvikling og drift av integrasjonsløysingar mellom analyseinstrument, laboratoriestøttesystem og LIMS
- utvikling og drift av system for driftsstatistikk og kvalitetskontroll
- at avdelinga ivaretar krav i ISO 15189 og IVDR
- utvikling av infrastruktur lokalt og nasjonalt
- nasjonale prosjekt og initiativ innan kreftgenomikk (InPreD, NorPreM)
- rådgiving og støtte knytt til bioinformatiske verktøy for forskings
- og diagnostiske formål
- effektiv kommunikasjonsrolle mellom Kreftgenomikk og Seksjon for bioinformatikk
- brukarstøtte og deltaking i tverrfaglege team
Kvalifikasjonar
- PhD innanfor bioinformatikk, informatikk eller det biologiske fagfelt
- Programmeringsspråk: Go, Bash, Python, R
- Erfaring med verktøy og pipelines for handtering og analyse av NGS-data innan kreftgenomikk (t.d. GATK, FastQC, BWA, SAMtools, Nextflow)
- Statistiske analysar og QC-metrikker
- Erfaring med arbeid på HPC-cluster, Kubernetes, Slurm og Docker
- Erfaring med drift av Linux
- Erfaring med metodologiar som GitOps, DevOps og TDD
- Forståing av og gjerne erfaring med molekylærbiologiske laboratorieprosessar
- Meistre engelsk munnleg og skriftleg
- God kunnskap i norsk eller eit anna skandinavisk språk er ein fordel
Personlege eigenskapar
- Stillinga føreset evne til sjølvstendig og nøyaktig arbeid og det vil bli lagt vekk på personlege eigenskapar, samarbeids
- og kommunikasjonsevner
- Søkar må trivast i eit tverrfagleg og aktivt miljø og samarbeide godt i team
- Søkar må evne til å jobbe med parallelle prosjekt og ha god gjennomføringsevne
- Søkar må være kreativ, løysings
- og serviceorientert
Vi tilbyr
- Løn etter avtale
- Høgt fagleg nivå med gode muligheter for fagleg utvikling
- Utfordrande arbeidsoppgåver
- Fleksibel arbeidstid
- Gode pensjons
- og forsikringsordningar
- Vi oppfordrar alle søkarar til å nytte Vitnemålsportalen for å laste opp verifiserte vitnemål og karakterutskrifter, der det er mogleg. Har du utdanning frå utlandet, legg ved godkjenning frå Direktoratet for høgare utdanning og kompetanse.
Adresse:
- Haukelandsveien 22, 5021 Bergen, Norge**Klikk for å leggje til kart**
Kontaktinformasjon
**Randi Hovland**
AvdelingssjefTelefon:
-
- Om arbeidsgivaren
Helse Bergen, Haukeland universitetssjukehus, har nærare14.000 tilsette som har som mål å gi best mogleg helsehjelp til pasientane våre, og rett opplæring til pasientar og pårørande. Kvart år behandlar vi over 900.000 pasientar og bidreg i utdanninga av fleire tusen helsearbeidarar. Forsking og innovasjon er og viktige oppgåver i sjukehuset.
- Helse Vest skal så langt som råd avspegle mangfaldet i befolkninga. Vi ønsker å rekruttere medarbeidarar uavhengig av kjønn med ulik kompetanse, fagkombinasjonar, livserfaring og perspektiv for å bidra i spesialisthelsetenesta.